1958年5月16日，經(jīng)福建省人民委員會以省人委（58）省辦秘字第2109號文批準，福建水電院正式成立。
建院初稱福建省水利電力廳設計院。
1958年9月更名為福建省水利電力廳勘測設計院。
1960年8月與科研所合并，更名為福建省水利電力廳科學研究勘測設計院。
1970年秋，更名為福建省革委會生產(chǎn)指揮部電力工業(yè)局設計大隊。
1971年4月，更名為福建省電力設計大隊
1977年5月，更名為福建省水利電力勘測設計院。
1983年10月，更名為福建省水利水電勘測設計院。
1993年10月，在獲百強后批準更名為福建省水利水電勘測設計研究院。
1996年10月，經(jīng)水利部批準更名升格為水利部福建水利水電勘測設計研究院，同時保留福建省水利水電勘測設計研究院名稱。
